Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv1P41164 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv1P41164 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Etv1P41164 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv1P41164 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv1P41164 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv1P41164 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv1P41164 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv1P41164 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Etv1P41164 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Etv1P41164 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv1P41164 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv1P41164 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv1P41164 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv1P41164 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv1P41164 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv1P41164 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Etv1P41164 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv1P41164 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Etv1P41164 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Etv1P41164 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Etv1P41164 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Etv1P41164 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Etv1P41164 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Etv1P41164 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Etv1P41164 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv1P41164 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv1P41164 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Etv1P41164 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Etv1P41164 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv1P41164 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv1P41164 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Etv1P41164 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv1P41164 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv1P41164 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv1P41164 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv1P41164 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Etv1P41164 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Etv1P41164 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms