Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sox5P35710 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox5P35710 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox5P35710 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox5P35710 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sox5P35710 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox5P35710 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox5P35710 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox5P35710 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox5P35710 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox5P35710 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox5P35710 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox5P35710 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox5P35710 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox5P35710 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox5P35710 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox5P35710 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox5P35710 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox5P35710 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox5P35710 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox5P35710 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox5P35710 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox5P35710 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox5P35710 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox5P35710 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sox5P35710 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox5P35710 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox5P35710 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox5P35710 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox5P35710 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox5P35710 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox5P35710 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms