Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab20P35295 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab20P35295 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab20P35295 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab20P35295 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab20P35295 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab20P35295 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab20P35295 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab20P35295 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab20P35295 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab20P35295 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab20P35295 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab20P35295 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab20P35295 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab20P35295 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab20P35295 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab20P35295 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab20P35295 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab20P35295 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms