Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab17P35292 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab17P35292 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab17P35292 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab17P35292 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab17P35292 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab17P35292 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab17P35292 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab17P35292 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab17P35292 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab17P35292 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab17P35292 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms