Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Notch4P31695 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Notch4P31695 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Notch4P31695 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Notch4P31695 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Notch4P31695 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Notch4P31695 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Notch4P31695 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Notch4P31695 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Notch4P31695 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Notch4P31695 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Notch4P31695 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Notch4P31695 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Notch4P31695 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms