Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tacr1P30548 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tacr1P30548 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tacr1P30548 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tacr1P30548 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tacr1P30548 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tacr1P30548 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tacr1P30548 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms