Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kif5cP28738 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kif5cP28738 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kif5cP28738 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kif5cP28738 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kif5cP28738 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kif5cP28738 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kif5cP28738 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms