Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa5P28312 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa5P28312 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa5P28312 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa5P28312 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa5P28312 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa5P28312 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa5P28312 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa5P28312 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa5P28312 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa5P28312 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa5P28312 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa5P28312 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa5P28312 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa5P28312 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa5P28312 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms