Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl3P27659 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpl3P27659 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl3P27659 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl3P27659 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl3P27659 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rpl3P27659 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3P27659 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl3P27659 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms