Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnna1P26231 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnna1P26231 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnna1P26231 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctnna1P26231 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctnna1P26231 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ctnna1P26231 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms