Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabra3P26049 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabra3P26049 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra3P26049 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra3P26049 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gabra3P26049 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra3P26049 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms