Protein–RNA interactions for Protein: P24668

M6pr, Cation-dependent mannose-6-phosphate receptor, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
M6prP24668 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
M6prP24668 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
M6prP24668 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
M6prP24668 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
M6prP24668 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
M6prP24668 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
M6prP24668 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
M6prP24668 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
M6prP24668 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
M6prP24668 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
M6prP24668 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
M6prP24668 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
M6prP24668 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
M6prP24668 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
M6prP24668 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
M6prP24668 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
M6prP24668 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
M6prP24668 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
M6prP24668 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
M6prP24668 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
M6prP24668 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
M6prP24668 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
M6prP24668 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
M6prP24668 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
M6prP24668 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
M6prP24668 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
M6prP24668 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
M6prP24668 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
M6prP24668 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
M6prP24668 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
M6prP24668 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
M6prP24668 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
M6prP24668 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
M6prP24668 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
M6prP24668 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
M6prP24668 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
M6prP24668 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
M6prP24668 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
M6prP24668 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
M6prP24668 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
M6prP24668 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
M6prP24668 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
M6prP24668 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
M6prP24668 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
M6prP24668 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
M6prP24668 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
M6prP24668 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
M6prP24668 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
M6prP24668 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
M6prP24668 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
M6prP24668 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
M6prP24668 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
M6prP24668 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
M6prP24668 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
M6prP24668 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
M6prP24668 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
M6prP24668 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
M6prP24668 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
M6prP24668 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
M6prP24668 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
M6prP24668 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
M6prP24668 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
M6prP24668 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
M6prP24668 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
M6prP24668 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
M6prP24668 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
M6prP24668 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
M6prP24668 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
M6prP24668 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
M6prP24668 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
M6prP24668 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
M6prP24668 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
M6prP24668 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
M6prP24668 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
M6prP24668 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
M6prP24668 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
M6prP24668 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
M6prP24668 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
M6prP24668 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
M6prP24668 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
M6prP24668 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
M6prP24668 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
M6prP24668 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
M6prP24668 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
M6prP24668 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
M6prP24668 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
M6prP24668 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
M6prP24668 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
M6prP24668 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
M6prP24668 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
M6prP24668 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
M6prP24668 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
M6prP24668 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms