Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Aldh1a1P24549 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Aldh1a1P24549 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Aldh1a1P24549 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aldh1a1P24549 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a1P24549 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a1P24549 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aldh1a1P24549 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.7 ms