Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria1P23818 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gria1P23818 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria1P23818 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gria1P23818 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gria1P23818 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gria1P23818 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gria1P23818 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gria1P23818 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gria1P23818 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gria1P23818 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gria1P23818 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gria1P23818 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gria1P23818 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria1P23818 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria1P23818 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gria1P23818 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria1P23818 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria1P23818 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria1P23818 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria1P23818 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria1P23818 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms