Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsta3P23591 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsta3P23591 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsta3P23591 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsta3P23591 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsta3P23591 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsta3P23591 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsta3P23591 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tsta3P23591 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms