Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ggta1P23336 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ggta1P23336 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ggta1P23336 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ggta1P23336 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ggta1P23336 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggta1P23336 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms