Protein–RNA interactions for Protein: P20612

Gnat1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnat1P20612 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gnat1P20612 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gnat1P20612 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gnat1P20612 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gnat1P20612 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gnat1P20612 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gnat1P20612 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gnat1P20612 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gnat1P20612 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnat1P20612 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gnat1P20612 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gnat1P20612 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms