Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pou5f1P20263 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou5f1P20263 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pou5f1P20263 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pou5f1P20263 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou5f1P20263 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou5f1P20263 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms