Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trap1aP19473 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trap1aP19473 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trap1aP19473 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trap1aP19473 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trap1aP19473 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trap1aP19473 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trap1aP19473 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trap1aP19473 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trap1aP19473 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Trap1aP19473 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trap1aP19473 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trap1aP19473 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trap1aP19473 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trap1aP19473 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms