Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifrd1P19182 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifrd1P19182 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ifrd1P19182 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ifrd1P19182 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ifrd1P19182 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifrd1P19182 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifrd1P19182 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms