Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama1P19137 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lama1P19137 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama1P19137 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama1P19137 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama1P19137 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lama1P19137 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama1P19137 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama1P19137 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lama1P19137 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lama1P19137 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lama1P19137 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Lama1P19137 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lama1P19137 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 871.2 ms