Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MdkP12025 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MdkP12025 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MdkP12025 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MdkP12025 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MdkP12025 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MdkP12025 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MdkP12025 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MdkP12025 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MdkP12025 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MdkP12025 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MdkP12025 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MdkP12025 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MdkP12025 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MdkP12025 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MdkP12025 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MdkP12025 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MdkP12025 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MdkP12025 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MdkP12025 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MdkP12025 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MdkP12025 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MdkP12025 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MdkP12025 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MdkP12025 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MdkP12025 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MdkP12025 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MdkP12025 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MdkP12025 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MdkP12025 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MdkP12025 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MdkP12025 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MdkP12025 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MdkP12025 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MdkP12025 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MdkP12025 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MdkP12025 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MdkP12025 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MdkP12025 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MdkP12025 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MdkP12025 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MdkP12025 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MdkP12025 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MdkP12025 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MdkP12025 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MdkP12025 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MdkP12025 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MdkP12025 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MdkP12025 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MdkP12025 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MdkP12025 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MdkP12025 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MdkP12025 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MdkP12025 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MdkP12025 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MdkP12025 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MdkP12025 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MdkP12025 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MdkP12025 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MdkP12025 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MdkP12025 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MdkP12025 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MdkP12025 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MdkP12025 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MdkP12025 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MdkP12025 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MdkP12025 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MdkP12025 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MdkP12025 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MdkP12025 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MdkP12025 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MdkP12025 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MdkP12025 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MdkP12025 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MdkP12025 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MdkP12025 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MdkP12025 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MdkP12025 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MdkP12025 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MdkP12025 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MdkP12025 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MdkP12025 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MdkP12025 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MdkP12025 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms