Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prf1P10820 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prf1P10820 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prf1P10820 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prf1P10820 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prf1P10820 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prf1P10820 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prf1P10820 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prf1P10820 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prf1P10820 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prf1P10820 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prf1P10820 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prf1P10820 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prf1P10820 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prf1P10820 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prf1P10820 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prf1P10820 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prf1P10820 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prf1P10820 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prf1P10820 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prf1P10820 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms