Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem254aP0DN89 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem254aP0DN89 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem254aP0DN89 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem254aP0DN89 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem254aP0DN89 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.5 ms