Protein–RNA interactions for Protein: P08884

Gzme, Granzyme E, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmeP08884 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmeP08884 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GzmeP08884 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GzmeP08884 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GzmeP08884 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GzmeP08884 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GzmeP08884 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GzmeP08884 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GzmeP08884 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GzmeP08884 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GzmeP08884 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GzmeP08884 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GzmeP08884 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GzmeP08884 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GzmeP08884 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GzmeP08884 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GzmeP08884 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GzmeP08884 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GzmeP08884 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GzmeP08884 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GzmeP08884 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GzmeP08884 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GzmeP08884 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GzmeP08884 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GzmeP08884 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GzmeP08884 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GzmeP08884 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GzmeP08884 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GzmeP08884 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmeP08884 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmeP08884 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmeP08884 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GzmeP08884 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GzmeP08884 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GzmeP08884 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GzmeP08884 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GzmeP08884 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GzmeP08884 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GzmeP08884 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GzmeP08884 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms