Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrlP06879 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrlP06879 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrlP06879 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PrlP06879 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrlP06879 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrlP06879 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrlP06879 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrlP06879 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrlP06879 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrlP06879 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrlP06879 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrlP06879 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrlP06879 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PrlP06879 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrlP06879 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrlP06879 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrlP06879 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrlP06879 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrlP06879 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrlP06879 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrlP06879 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PrlP06879 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrlP06879 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrlP06879 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrlP06879 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrlP06879 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrlP06879 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrlP06879 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrlP06879 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrlP06879 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrlP06879 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrlP06879 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrlP06879 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrlP06879 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrlP06879 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrlP06879 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrlP06879 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrlP06879 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrlP06879 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PrlP06879 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrlP06879 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrlP06879 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PrlP06879 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrlP06879 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrlP06879 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrlP06879 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrlP06879 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrlP06879 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrlP06879 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrlP06879 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrlP06879 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrlP06879 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrlP06879 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrlP06879 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrlP06879 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrlP06879 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrlP06879 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrlP06879 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrlP06879 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrlP06879 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrlP06879 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrlP06879 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrlP06879 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrlP06879 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrlP06879 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms