Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06324 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06324 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06324 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P06324 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06324 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06324 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P06324 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06324 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06324 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06324 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06324 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06324 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P06324 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06324 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
P06324 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06324 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06324 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P06324 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P06324 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06324 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06324 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06324 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06324 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06324 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06324 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P06324 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06324 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06324 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06324 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P06324 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P06324 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P06324 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P06324 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P06324 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06324 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06324 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06324 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P06324 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06324 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06324 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06324 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06324 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06324 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06324 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06324 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P06324 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P06324 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P06324 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P06324 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P06324 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P06324 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P06324 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P06324 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P06324 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P06324 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P06324 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06324 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06324 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06324 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06324 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06324 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06324 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06324 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06324 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06324 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06324 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06324 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P06324 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P06324 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P06324 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P06324 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P06324 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P06324 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P06324 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P06324 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P06324 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06324 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06324 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06324 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06324 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P06324 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P06324 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P06324 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P06324 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P06324 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P06324 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
P06324 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P06324 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P06324 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P06324 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P06324 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06324 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06324 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06324 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06324 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06324 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06324 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06324 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06324 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms