Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl1P05977 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Myl1P05977 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl1P05977 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl1P05977 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl1P05977 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Myl1P05977 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Myl1P05977 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myl1P05977 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl1P05977 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl1P05977 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl1P05977 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myl1P05977 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myl1P05977 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myl1P05977 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myl1P05977 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myl1P05977 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myl1P05977 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myl1P05977 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms