Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FosP01101 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FosP01101 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FosP01101 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FosP01101 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FosP01101 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FosP01101 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FosP01101 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FosP01101 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FosP01101 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FosP01101 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FosP01101 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FosP01101 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FosP01101 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FosP01101 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FosP01101 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FosP01101 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FosP01101 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FosP01101 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FosP01101 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosP01101 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosP01101 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosP01101 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FosP01101 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FosP01101 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FosP01101 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FosP01101 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FosP01101 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FosP01101 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FosP01101 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FosP01101 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FosP01101 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FosP01101 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FosP01101 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FosP01101 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FosP01101 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FosP01101 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FosP01101 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FosP01101 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FosP01101 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FosP01101 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FosP01101 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FosP01101 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FosP01101 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FosP01101 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FosP01101 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FosP01101 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FosP01101 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FosP01101 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FosP01101 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FosP01101 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FosP01101 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FosP01101 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FosP01101 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FosP01101 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FosP01101 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FosP01101 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FosP01101 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FosP01101 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FosP01101 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FosP01101 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FosP01101 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FosP01101 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FosP01101 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FosP01101 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FosP01101 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FosP01101 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FosP01101 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FosP01101 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FosP01101 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FosP01101 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FosP01101 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FosP01101 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FosP01101 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FosP01101 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FosP01101 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FosP01101 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FosP01101 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FosP01101 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FosP01101 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FosP01101 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FosP01101 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FosP01101 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FosP01101 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FosP01101 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FosP01101 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FosP01101 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FosP01101 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FosP01101 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FosP01101 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FosP01101 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FosP01101 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FosP01101 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FosP01101 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FosP01101 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FosP01101 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FosP01101 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FosP01101 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FosP01101 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FosP01101 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms