Protein–RNA interactions for Protein: O89103

Cd93, Complement component C1q receptor, mousemouse

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd93O89103 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd93O89103 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd93O89103 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd93O89103 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd93O89103 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd93O89103 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd93O89103 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd93O89103 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd93O89103 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd93O89103 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd93O89103 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd93O89103 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd93O89103 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd93O89103 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd93O89103 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd93O89103 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd93O89103 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd93O89103 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd93O89103 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd93O89103 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd93O89103 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms