Protein–RNA interactions for Protein: O88829

St3gal5, Lactosylceramide alpha-2,3-sialyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St3gal5O88829 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
St3gal5O88829 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
St3gal5O88829 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
St3gal5O88829 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
St3gal5O88829 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
St3gal5O88829 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
St3gal5O88829 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
St3gal5O88829 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
St3gal5O88829 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
St3gal5O88829 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
St3gal5O88829 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
St3gal5O88829 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
St3gal5O88829 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms