Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClppO88696 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClppO88696 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClppO88696 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClppO88696 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ClppO88696 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClppO88696 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ClppO88696 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClppO88696 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClppO88696 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClppO88696 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClppO88696 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ClppO88696 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClppO88696 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClppO88696 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClppO88696 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClppO88696 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClppO88696 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClppO88696 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClppO88696 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClppO88696 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClppO88696 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ClppO88696 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClppO88696 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClppO88696 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClppO88696 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClppO88696 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClppO88696 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ClppO88696 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClppO88696 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClppO88696 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClppO88696 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClppO88696 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClppO88696 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClppO88696 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClppO88696 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClppO88696 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClppO88696 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClppO88696 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClppO88696 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ClppO88696 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClppO88696 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClppO88696 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClppO88696 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClppO88696 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClppO88696 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClppO88696 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClppO88696 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClppO88696 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClppO88696 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClppO88696 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClppO88696 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClppO88696 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClppO88696 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClppO88696 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClppO88696 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClppO88696 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClppO88696 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClppO88696 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClppO88696 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClppO88696 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClppO88696 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClppO88696 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClppO88696 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClppO88696 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClppO88696 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClppO88696 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ClppO88696 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClppO88696 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClppO88696 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClppO88696 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClppO88696 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClppO88696 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClppO88696 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClppO88696 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClppO88696 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClppO88696 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClppO88696 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClppO88696 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClppO88696 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClppO88696 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClppO88696 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClppO88696 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClppO88696 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClppO88696 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClppO88696 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClppO88696 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ClppO88696 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClppO88696 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClppO88696 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClppO88696 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClppO88696 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClppO88696 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClppO88696 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClppO88696 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClppO88696 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClppO88696 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ClppO88696 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClppO88696 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ClppO88696 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms