Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shoc2O88520 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shoc2O88520 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shoc2O88520 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shoc2O88520 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shoc2O88520 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Shoc2O88520 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms