Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cfdp1O88271 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cfdp1O88271 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Cfdp1O88271 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cfdp1O88271 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cfdp1O88271 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cfdp1O88271 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cfdp1O88271 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cfdp1O88271 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cfdp1O88271 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cfdp1O88271 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cfdp1O88271 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms