Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sap18O55128 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sap18O55128 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sap18O55128 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sap18O55128 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sap18O55128 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sap18O55128 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sap18O55128 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sap18O55128 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sap18O55128 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sap18O55128 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sap18O55128 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sap18O55128 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sap18O55128 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sap18O55128 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sap18O55128 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sap18O55128 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sap18O55128 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms