Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff2O55112 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff2O55112 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff2O55112 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aff2O55112 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aff2O55112 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aff2O55112 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff2O55112 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff2O55112 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff2O55112 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff2O55112 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Aff2O55112 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Aff2O55112 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aff2O55112 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aff2O55112 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms