Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csnk2a2O54833 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csnk2a2O54833 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csnk2a2O54833 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Csnk2a2O54833 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Csnk2a2O54833 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms