Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek2O35942 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nek2O35942 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek2O35942 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek2O35942 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek2O35942 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek2O35942 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek2O35942 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek2O35942 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek2O35942 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek2O35942 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek2O35942 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek2O35942 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek2O35942 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek2O35942 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek2O35942 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek2O35942 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms