Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dsg3O35902 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Dsg3O35902 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dsg3O35902 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dsg3O35902 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg3O35902 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsg3O35902 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsg3O35902 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsg3O35902 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsg3O35902 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dsg3O35902 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsg3O35902 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dsg3O35902 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms