Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PrkcshO08795 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrkcshO08795 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PrkcshO08795 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PrkcshO08795 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PrkcshO08795 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrkcshO08795 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrkcshO08795 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PrkcshO08795 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PrkcshO08795 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms