Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tcof1O08784 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tcof1O08784 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tcof1O08784 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcof1O08784 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcof1O08784 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcof1O08784 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcof1O08784 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tcof1O08784 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcof1O08784 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms