Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn5O08688 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn5O08688 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Capn5O08688 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn5O08688 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn5O08688 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn5O08688 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn5O08688 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn5O08688 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn5O08688 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn5O08688 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn5O08688 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn5O08688 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn5O08688 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn5O08688 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn5O08688 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn5O08688 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn5O08688 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn5O08688 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms