Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efna3O08545 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efna3O08545 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna3O08545 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efna3O08545 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna3O08545 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efna3O08545 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna3O08545 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efna3O08545 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna3O08545 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efna3O08545 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna3O08545 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna3O08545 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efna3O08545 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efna3O08545 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Efna3O08545 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.4 ms