Protein–RNA interactions for Protein: L7N277

Gm7942, Predicted gene 7942, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7942L7N277 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm7942L7N277 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7942L7N277 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm7942L7N277 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm7942L7N277 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm7942L7N277 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm7942L7N277 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm7942L7N277 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm7942L7N277 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7942L7N277 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7942L7N277 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7942L7N277 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm7942L7N277 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm7942L7N277 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms