Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U0

Vmn1r142, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r142K7N6U0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r142K7N6U0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r142K7N6U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r142K7N6U0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r142K7N6U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r142K7N6U0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms