Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm379J3QQ19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm379J3QQ19 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm379J3QQ19 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm379J3QQ19 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm379J3QQ19 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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