Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spin2fJ3QPU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spin2fJ3QPU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spin2fJ3QPU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spin2fJ3QPU0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spin2fJ3QPU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spin2fJ3QPU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spin2fJ3QPU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spin2fJ3QPU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms