Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shisa8J3QNX5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shisa8J3QNX5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shisa8J3QNX5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shisa8J3QNX5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shisa8J3QNX5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shisa8J3QNX5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shisa8J3QNX5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms