Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm17577J3QNF7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17577J3QNF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17577J3QNF7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17577J3QNF7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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