Protein–RNA interactions for Protein: J3QMN6

Fmo6, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo6J3QMN6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fmo6J3QMN6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fmo6J3QMN6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fmo6J3QMN6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fmo6J3QMN6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Fmo6J3QMN6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fmo6J3QMN6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms